Главен герой на романа е капитан Симонини, авантюрист и шпионин. Според издателите и самия автор, в сюжета на книгата са вплетени много исторически събития като делото Драйфус, Парижката комуна, Рисорджименто, войни, революции, заговори, интриги и покушения. Както подчертава Еко, всички герои на "Пражкото гробище" са реално съществували исторически личности освен главния герой, който се явява събирателен образ. Еко казва, че се е стремил да направи капитан Симонини "най- отблъскващия циник на световната литература". Една от главните теми на романа е зараждането на съвременния антисемитизъм, в частност, изготвянето на "Протоколите на сионските мъдреци" - подправен сборник текстове, с чиято помощ създателите му (най- вероятно руският журналист Матвей Головинския, емигрант във Франция) са разчитали да "докажат" съществуването на световен еврейско - масонски заговор. Фигуриращото в заглавието на романа гробище е Старото еврейско гробище в центъра на Прага, където е погребан Йехуда Лев бен Бецалел, главният равин на Прага в края на ХVІ и началото на ХVІІ век, създател на легендарния голем. "Пражкото гробище" е шестият роман на Умберто Еко. Той излиза точно 30 години след дебютния му "Името на розата".